Prodiasur fue fundada el año 2002 como una iniciativa de jóvenes profesionales, con el objetivo de mejorar la calidad de vida de manera integral de familias rurales de cabeceras de valle de municipios de Sapahaqui y Ayo Ayo, bajo la mirada del desarrollo rural sostenible.

En sus primeros años Prodiasur, ha venido apoyando actividades en cinco comunidades y sesenta familias de los municipios de Sapahaqui y Ayo Ayo del departamento de La Paz, principalmente para dar respuesta a algunas problemáticas identificadas en la zona de intervención como ser: escasez de agua, deterioro de suelos productivos, poco involucramiento de las mujeres y falta de conocimiento de los derechos y deberes como ciudadanos bolivianos.

Se apoyó en la implementación de prácticas agroecológicas, conservación de suelos, cosecha de agua en estanques artesanales como una innovación tecnológica, agroforestería, huertos familiares, participación ciudadana y talleres de nutrición alternativa para garantizar la seguridad alimentaria.